{"id":3029,"date":"2020-02-28T08:37:03","date_gmt":"2020-02-28T08:37:03","guid":{"rendered":"http:\/\/cimti.cat\/ca\/?p=3029"},"modified":"2023-05-29T12:12:56","modified_gmt":"2023-05-29T12:12:56","slug":"trazan-el-perfil-bacteriano-de-la-patologia-intestinal-con-machine-learning","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/cimti.cat\/ca\/trazan-el-perfil-bacteriano-de-la-patologia-intestinal-con-machine-learning\/","title":{"rendered":"Trazan el perfil bacteriano de la patolog\u00eda intestinal con machine learning"},"content":{"rendered":"

Jaime Recarte<\/strong>, 24.02.2020 (redacci\u00f3n m\u00e9dica<\/em>)<\/p>\n

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Una start-up desarrolla test no invasivos de enfermedades intestinales a trav\u00e9s de “firmas biol\u00f3gicas”<\/h4>\n
Xavier Aldeguer.<\/div>\n<\/div>\n
\"Trazan<\/div>\n
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Una\u00a0start-up<\/strong>\u00a0originada en la\u00a0sanidad catalana<\/strong>\u00a0ha trazado el\u00a0perfil bacteriano<\/strong>, las firmas biol\u00f3gicas, de las\u00a0enfermedades inflamatorias intestinales<\/strong>. A trav\u00e9s de una serie de\u00a0marcadores\u00a0<\/strong>han conseguido obtener indicios de\u00a0qu\u00e9 sucede dentro del intestino humano<\/strong>\u00a0ante la enfermedad de Crohn, la enfermedad inflamatoria intestinal, el c\u00e1ncer de colon e, incluso, otras patolog\u00edas\u00a0inflamatorias inmunomediadas<\/a>\u00a0lejos del intestino, como la artritis reumatoide o la espondilitis anquilosante.<\/p>\n

Xavier Aldeguer<\/strong>, jefe del Servicio de Aparato Digestivo del\u00a0Hospital Universitario Dr. Josep Trueta<\/strong>\u00a0de Girona, detalla c\u00f3mo fue el cambio de enfoque a la hora de estudiar la flora intestinal. “Nuestro equipo ha trabajado durante unos 15 a\u00f1os en la\u00a0descripci\u00f3n de la microbiota<\/strong>\u00a0de las enfermedades inflamatorias intestinales y otras enfermedades como son el\u00a0colon irritable y el c\u00e1ncer de colon<\/strong>“, se\u00f1ala.<\/div>\n

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Esta tarea, considerada tan necesaria hoy en d\u00eda, fue sin embargo\u00a0revolucionaria\u00a0<\/strong>en aquel momento. Seg\u00fan cuenta Aldeguer, antes de empezar en este proyecto, parte del equipo se encontraba\u00a0estudiando el lago de Banyoles, en Girona<\/strong>, con t\u00e9cnicas de biolog\u00eda molecular. “La idea que hoy se ve tan clara fue: \u00bfpor qu\u00e9 no aplicamos el an\u00e1lisis del ecosistema al intestino humano?”. Y es que, seg\u00fan explica, cuando hablamos del intestino humano, “hablamos de un ecosistema, que tiene cambios como cualquier otro ecosistema”.<\/div>\n
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Esa es la clave que Aldeguer, director m\u00e9dico de\u00a0GoodGut<\/a>, la start-up que han desarrollado, y su equipo han aplicado al estudio del intestino. Comprender los cambios en el intestino, las disbiosis intestinales, como indicador o “chivato” de otras patolog\u00edas. “Somos pioneros en el desarrollo de estas firmas biol\u00f3gicas; es la primera vez que se pone de manifiesto la utilidad cl\u00ednica real” de estos marcadores, cuenta.<\/p>\n

As\u00ed, en lugar de analizar la carga bacteriana en las heces, han acudido directamente a la pared intestinal: “Hemos ido directamente a la biopsia y hemos estudiado directamente la capa de bacterias m\u00e1s \u00edntimamente adheridas a nuestra mucosa, las que realmente nos acompa\u00f1a”. “A partir de ah\u00ed hemos\u00a0descrito cambios que se dan, por ejemplo, en enfermedad de Crohn<\/strong>,\u00a0 uno de los grandes modelos de disbiosis, es decir, de alteraci\u00f3n del perfil bacteriano”.<\/div>\n

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Marcadores<\/h2>\n<\/div>\n
Con el paso del tiempo fueron perfilando el tipo de bacterias que se encontraban m\u00e1s frecuentemente asociadas a determinadas enfermedades, “la asociaci\u00f3n\u00a0 m\u00e1s clara fue en c\u00e1ncer de colon”. Con esa informaci\u00f3n han desarrollado un primer marcador no invasivo, que junto con la sangre oculta en heces, es un buen indicador de la posible patolog\u00eda. “La clave ha venido cuando hemos generado un algoritmo a partir de t\u00e9cnicas de\u00a0machine learning<\/em>. Tomamos una serie de bacterias, dependiendo en funci\u00f3n del marcador, e iterativamente vamos testando las muestras”, detalla.<\/p>\n

As\u00ed, por un lado han desarrollado “un\u00a0marcador de c\u00e1ncer de colon<\/strong>\u00a0que ya ha obtenido el marcado CE de comercializaci\u00f3n para complementar la b\u00fasqueda de sangre oculta en heces, ofreciendo una mayor especificidad” y “reduciendo el n\u00famero de colonoscopias”.\u00a0 “Mientras tanto estamos haciendo una validaci\u00f3n cl\u00ednica de 2.500 muestras de un biobanco alem\u00e1n de screening para probar nuestro valor predictivo”, apunta.<\/div>\n

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Tambi\u00e9n se encuentran “en fase de validaci\u00f3n cl\u00ednica de un\u00a0marcador de seguimiento de enfermedad inflamatoria intestinal<\/strong>” que, en lugar de medir la calprotectina en heces de pacientes con estas patolog\u00edas, (“un nivel bajo de esta prote\u00edna se relaciona con lesiones intestinales”, explica el jefe de digestivo), mide el perfil microbiano, “que es m\u00e1s preciso que el marcador de inflamaci\u00f3n”.<\/p>\n

“Otro marcador que estamos desarrollando es el de\u00a0predicci\u00f3n de respuesta a tratamientos biol\u00f3gicos<\/strong>\u00a0en enfermedad inflamatoria intestinal”, detalla el digest\u00f3logo, algo que ayude a explicar por qu\u00e9 hay pacientes que no responden a los tratamientos, que actualmente se encuentra “en prueba de concepto”.<\/div>\n

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Las bacterias y ser humano<\/h2>\n

El jefe de Aparato Digestivo va m\u00e1s all\u00e1 en la relaci\u00f3n que el ser humano mantiene con las poblaciones bacterianas, y apunta que estos organismos juegan un papel decisivo. “El ser humano es un ser simbi\u00f3tico<\/strong>“, detalla\u00a0 y sostiene que en nuestro organismo hay “1,3 bacterias por cada c\u00e9lula humana<\/strong>“. “Los digestivos fuimos los primeros en interesarnos en la disbiosis intestinal, porque somos los que trabajamos en el \u00f3rgano que tiene un mayor contenido de bacterias de todo nuestro cuerpo, que es el colon”.<\/p>\n

“Lo que no sab\u00edamos era que est\u00e1bamos abriendo la caja de Pandora. Ahora sabemos que lo que est\u00e1bamos describiendo\u00a0es un \u00f3rgano en s\u00ed mismo<\/strong>“. As\u00ed, en opini\u00f3n de este investigador, la flora intestinal es “un \u00f3rgano con capacidad metab\u00f3lica de producci\u00f3n de\u00a0prote\u00ednas, l\u00edpidos y energ\u00eda<\/strong>\u00a0que, por tanto, interact\u00faa con nuestro cuerpo”. Por todo ello, se\u00f1ala que el futuro pasa por el estudio de estas disbiosis en relaci\u00f3n de otras patolog\u00edas inmunomediadas, como “la\u00a0psoriasis, la artrosis reumatoide o la espondilitis anquilosante<\/strong>“.<\/p>\n

“Lo que creo que hay que tener claro es que\u00a0estamos en una fase descriptiva<\/strong>. Es decir, todav\u00eda nos falta informaci\u00f3n para llegar a la explicaci\u00f3n patog\u00e9nica. Y ah\u00ed est\u00e1 la clave que tenemos en\u00a0GoodGut<\/a>, puesto que, por el momento, si las bacterias nos pueden decir algo es como marcadores, pero si queremos ir m\u00e1s all\u00e1”, concluye.<\/div>\n

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